Rutunga avait été extradé des Pays-Bas vers le Rwanda en 2021, où il a été jugé pour des massacres qu'il aurait ordonnés il y a plus de 25 ans. Selon l'accusation, citant des témoins, il aurait fait venir des policiers à l'ISAR, l'institut de recherche agricole où il était directeur régional, pour éliminer les employés tutsis et ceux cherchant refuge sur place.
Convaincu de son innocence, Rutunga avait plaidé non coupable, affirmant qu'il avait appelé les agents pour assurer la sécurité de l'ISAR, avec l'approbation du conseil d'administration de l'institution.
Arrêté aux Pays-Bas en 2019 après un mandat d'arrêt émis par le Rwanda, Rutunga a été l'une des nombreuses personnes poursuivies pour leur rôle dans le génocide rwandais, qui a coûté la vie à plus de 800 000 personnes entre avril et juillet 1994.
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